- Musée Musee Tour De Guet
- Musée Musée du Vieux Pérouges
- Musée Musée de la vigne de Vaux-en-Bugey
- Musée Musée du Cheminot
- Musée Conservatoire de la Fondation Berliet
- Musée Patrimoine, culture et traditions
- Musée Château des Allymes
- Musée Musée archéologique de Hières-sur-Amby
- Musée Musée-Maison du Patrimoine
- Musée Musée d'art et d'histoire locale
- Musée Apothicairerie de Montluel
- Musée Musée des traditions bugistes
- Musée Missions 2070
- Musée Musée Autrefois
- Musée Musée de la Lauze
- Musée Ecomusée les Vieux Clous
- Musée Maison de la Pierre et du Ciment
- Musée Musée des Soieries Bonnet
- Musée Musée de la Lauze
- Musée Musée Louis Jourdan
- Musée Minéralogica
- Musée Espace Comté d'Aranc
- Musée Centre d'art contemporain de Lacoux
- Musée Cuivrerie de Cerdon
- Musée OL Le Musée
- Musée Musée Testut-Latarjet
- Musée Espace Muséal de Gandil
- Musée Musée du train miniature
- Musée Les musées de l'Hôtel Dieu
- Musée Micro-Folie® - Musée numérique
- Musée Musée municipal de Bourg-en-Bresse
- Musée Monastère Royal de Brou