- Musée Musée de plein air Étang Rouge
- Musée Musée de la Saône et des Gens de la Saône
- Musée Musée de plein air l'Etang Rouge
- Musée Maison du patrimoine rural jurassien
- Musée Musée des sapeurs-pompiers (Pierre Morisot)
- Musée Musée de la batellerie
- Musée Maison du Patrimoine
- Musée Musée du Blé et du Pain
- Musée Écomusée de la Bresse bourguignonne
- Musée Musée municipal
- Musée L'Imaginarium - Votre étape oenodivertissante en Bourgogne
- Musée Le Cassissium
- Musée Musée de Nuits-Saint-Georges
- Musée Historial de l'Amitié Franco-Américaine de Beaune
- Musée Cité des Climats et vins de Bourgogne - Beaune
- Musée Musée des Beaux-Arts de Beaune
- Musée Musée du Vin de Bourgogne
- Musée Hospices de Beaune
- Musée Maison Jacques-Copeau
- Musée L'Etang de Jean
- Musée La Maison de la Forêt et du Bocage
- Musée Archéodrome de Beaune
- Musée Château de Savigny - Musée de la moto, de l'aviation et de la voiture de course
- Musée Collection d'avions de chasse
- Musée Collection de véhicules de pompiers
- Musée Collection d'Engins agricoles
- Musée Musée des Beaux-Arts de Dole
- Musée Ma première visite au musée
- Musée Chapelle des Jésuites
- Musée Maison natale de Louis Pasteur
- Musée Musée de l'écluse 62
- Musée Jura Météorites
- Musée Maison de l'Agriculture et de l'Alimentation