- Musée Musée de La Vie Rurale
- Musée La Grange Chevrotière
- Musée Musée-Galerie Clauorum
- Musée Musée de Bourgoin-Jallieu
- Musée Maison de la photographie Muroise
- Musée Jean Devron
- Musée Musée Drevon
- Musée Minéralogica
- Musée Musée de Saint-Chef
- Musée Espace Muséal de Gandil
- Musée Musée de la Lauze
- Musée Musée de l'Aviation Lyon-Corbas
- Musée Musée Autrefois
- Musée Musée de la Lauze
- Musée OL Le Musée
- Musée Écomusée du patrimoine des métiers
- Musée Les anciens métiers de Bossieu
- Musée L’Aéromusée
- Musée Musée-Maison du Patrimoine
- Musée Musée archéologique de Hières-sur-Amby
- Musée Musée de la Résistance et de la Déportation
- Musée Musée de l'Industrie Textile
- Musée Maison des Arts
- Musée Patrimoine, culture et traditions
- Musée Musée des Passions - Le Foulon
- Musée Centre d'Art Contemporain La Halle des Bouchers
- Musée Cloître Saint André-le-Bas
- Musée Salle du Patrimoine
- Musée Musée des Beaux-Arts et d'Archéologie
- Musée Musée et Sites Archéologiques de Saint-Romain-en-Gal
- Musée Musée archéologique Saint-Pierre de Vienne
- Musée Classe-Musée
- Musée Maison Ravier
- Musée Droguier de Lyon
- Musée Musée d'histoire de la médecine et de la pharmacie de Lyon
- Musée Musée Hector-Berlioz
- Musée Cité musée Tony
- Musée Musée des Liqueurs Cherry Rocher
- Musée Institut Lumière
- Musée Musée Lumière
- Musée Apothicairerie de Montluel
- Musée Mémorial National de la prison de Montluc
- Musée Institut d'art contemporain
- Musée Musée d'art et d'histoire locale
- Musée Musée d'Artisanat Rural
- Musée Musée des Moulages (MuMo)
- Musée Institut Culturel du Judaïsme
- Musée La Maison Hosotte
- Musée Maison des mathématiques et de l'informatique
- Musée Centre d'Histoire de la Résistance et de la Déportation (CHRD)
- Musée Musée d'Histoire Militaire de Lyon et de sa Région
- Musée Le Petit Musée du Vin
- Musée Musée de l'informatique du centre de calcul de l'IN2P3
- Musée Musée des Confluences
- Musée Tomaselli Collection
- Musée Musée des Tissus
- Musée Musée Soieries Brochier
- Musée Musée de l'Illusion
- Musée Musée des Tisserands
- Musée Musée du Tisserand Dauphinois
- Musée Cité Internationale de la Gastronomie
- Musée Musée des géomètres-experts de la région Auvergne-Rhône-Alpes
- Musée Histoire de la Galoche
- Musée Maison de la Pierre et du Ciment
- Musée Science Expériences
- Musée Fondation Bullukian
- Musée Le Rectangle
- Musée Musée de l'Imprimerie et de la communication graphique
- Musée Musée des Hospices Civils de Lyon
- Musée Musée Testut-Latarjet
- Musée Musée " Histoire de la galoche"
- Musée Le Musée du Caveau