- Musée Club de Modélisme Ferroviaire et Musée des Rotondes
- Musée Musée Denon
- Musée Musée du Souvenir du Combattant
- Musée Espace Patrimoine
- Musée Musée Nicéphore Niépce
- Musée Musée de l'Ecole en Chalonnais
- Musée Musée Maison Nicéphore Niépce
- Musée Une vie de taille - Ivan Avoscan
- Musée Musée du Vigneron
- Musée La Maison de la Forêt et du Bocage
- Musée Maison du Patrimoine et Café de Pays
- Musée Archéodrome de Beaune
- Musée Musée du Blé et du Pain
- Musée Musée de la vigne et du vin du vigneron
- Musée Musée International des Parachutistes du Special Air Service
- Musée Le Petit Collectionneur
- Musée Cité des Climats et vins de Bourgogne - Beaune
- Musée Écomusée
- Musée Musée des Beaux-Arts de Beaune
- Musée Hospices de Beaune
- Musée La Villa Perrusson et son jardin - Écomusée Creusot Montceau
- Musée Musée du Vin de Bourgogne
- Musée Historial de l'Amitié Franco-Américaine de Beaune
- Musée Maison Plissonnier
- Musée Collection d'avions de chasse
- Musée Collection de véhicules de pompiers
- Musée Collection d'Engins agricoles
- Musée Château de Savigny - Musée de la moto, de l'aviation et de la voiture de course
- Musée Maison du Patrimoine
- Musée L'Etang de Jean
- Musée Musée bourguignon Perrin de Puycousin
- Musée Hôtel-Dieu-Musée Greuze
- Musée Musée du Vélo - Michel Grézaud
- Musée Maison Jacques-Copeau
- Musée Musée du Donjon - Musée Raymond Rochette