- Musée La Maison de la Mémoire Cuisellienne
- Musée Coligny Car Muséum
- Musée Calendrier gaulois et dieu de Coligny
- Musée Espace d'Artagnan
- Musée Galerie des Moulins
- Musée Ferme de la Forêt
- Musée Moulin de Pont des Vents
- Musée Le Moulin de la Croix
- Musée Musée Histoire et Culture des Sourds
- Musée Musée de l'Ours
- Musée Musée des Beaux-Arts de Louhans
- Musée Musée de l'imprimerie
- Musée Ecomusée Les Outils d'Autrefois
- Musée Musée du Revermont
- Musée Musée du Terroir et de la Volaille
- Musée Musée de la mode du 18ème 19ème siècle
- Musée Écomusée Maison de Pays en Bresse
- Musée Moulin-Musée de Ménetreuil
- Musée Moulin de Montjay
- Musée Ferme de Sougey
- Musée Maison de la Poupée
- Musée Musée du Vélo
- Musée Centre Eden, Education-Découverte-Nature
- Musée Maison Plissonnier
- Musée Maison natale de Rouget de Lisle
- Musée Apothicairerie de l'hôtel-dieu
- Musée Musée des Beaux-Arts
- Musée La Maison de La Vache qui rit
- Musée Musée de véhicules anciens
- Musée Centre de Conservation et d’Etude René Rémond