- Musée Musée du cinéma d'animation
- Musée Centre d’Interprétation de l’Architecture et du Patrimoine
- Musée Musée d'art contemporain et d'art régional
- Musée Observatoire régional des lacs alpins
- Musée Musée-Château d'Annecy
- Musée Maison de la Galerie
- Musée Ecomusée du Lac d'Annecy
- Musée Musée Paccard
- Musée Musée Léon Marès
- Musée Maison de Pays du Laudon
- Musée Fondation Art Contemporain Claudine et Jean-Marc Salomon
- Musée Musée français de la Fausse Monnaie
- Musée Nécropole nationale des Glières / site de Morette
- Musée Musée départemental de la Résistance haut-savoyarde et mémorial départemental de la déportation
- Musée Musée de la Cordonnerie
- Musée Musée de la Nature
- Musée Ecomusée du Bois et de la Forêt
- Musée Notre Histoire - Musée de Rumilly
- Musée Musée Patrimonial du Pays de Thônes - Fondateurs : François et Lucien Cochat
- Musée Salle des maquettes des Amis du Val de Thônes
- Musée Musée de la Poterie Savoyarde
- Musée Mémoire du Maquis
- Musée La maison du Père Fouettard
- Musée Deumeure du Père Noël
- Musée Maison du Salève
- Musée Maison de la pomme et du biscantin
- Musée Musée de la Vache et des Alpages
- Musée Musée Archéologique de Viuz-Faverges
- Musée Micro-Folie
- Musée Pass 3 sites 3 histoires : Musée archéologique - Museum des papillons - Donjon des Seigneurs
- Musée Muséum des Papillions et des Insectes
- Musée Le Hameau des Alpes
- Musée Le pont des z'arts
- Musée Maison du Parc : Espace découverte
- Musée La Maison du patrimoine
- Musée Musée Gallo-Romain
- Musée Maison de l'Artisanat
- Musée Maison Faune-Flore
- Musée Musée Faure
- Musée Le Salève secret
- Musée Musée des Arts et Traditions Populaires du Val d'Arly
- Musée À la Rencontre du Passé
- Musée Musée de la Taillanderie Busillet