- Musée Musée de l'Aventure du Son
- Musée La ferme du Château
- Musée La Bâtisse
- Musée La Grange d'Accueil
- Musée Maison natale de Colette
- Musée Musée Colette
- Musée Musée de la mémoire potière
- Musée Musée du Grès
- Musée Musée du Grès
- Musée Musée d'Art et d'Histoire de Puisaye
- Musée Moulin du Vanneau
- Musée Musée d’arts, d’histoire et d’archéologie
- Musée Hôtel Dieu
- Musée Auto Sport Museum
- Musée Château de La Bussière
- Musée Musée des Deux Marines et du Pont-canal
- Musée Musée des Émaux et de la Mosaïque (visite possible pour les groupes à partir de 10 pers. sur résa uniquement)
- Musée Musée municipal de Préhistoire et d'Histoire
- Musée Espace culturel-Mairie
- Musée Espace EDF Odysselec
- Musée Musée paysan de la Bourgogne Nivernaise "Ferme de Cadoux"
- Musée Maison de Loire du Cher
- Musée Centre Régional d'Art Contemporain
- Musée Galerie de l'Ancienne Poste
- Musée Espace Pierre Larousse
- Musée Musée de la Bataille de Fontenoy
- Musée La grange des métiers d'autrefois
- Musée La Pyramide du Loup
- Musée Musée de la Machine Agricole et de la Ruralité (le MUMAR) à Saint-Loup-des-Bois
- Musée Musée Jean Larcena
- Musée Musée de la Chirurgie Pr Christian Cabrol
- Musée Château-musée de Gien. Chasse, Histoire et Nature en Val de Loire
- Musée Musée Vivant de l'Apiculture Gâtinaise
- Musée La Fabuloserie - Musée d'art hors-les-normes/art brut
- Musée Musée de la Faïencerie de Gien
- Musée La Métairie Bruyère - Centre d'Art Graphique
- Musée Exposition "la police à papa"
- Musée Muséum d'Histoire Naturelle de Puisaye