- Musée Musée de l'Artisanat
- Musée Mémorial de Haute-Alsace
- Musée Le musée d'Histoire de la Citadelle
- Musée Tour 41 : musée des beaux arts
- Musée Tour 46
- Musée Galerie Cheloudiakoff
- Musée Musée d'art moderne - Donation Maurice Jardot
- Musée Forge-musée
- Musée L’épopée Bull informatique au musée de la Mécanographie
- Musée Patrimoine Belfortain industrie informatique
- Musée Musée agricole départemental
- Musée Maison de la Terre de Haute Alsace
- Musée Maison du Patrimoine
- Musée Musée de l'Histoire
- Musée Maison départementale de l'environnement
- Musée Musée Japy
- Musée Musée Sundgauvien
- Musée Centre Rhénan d'Art Contemporain (CRAC Alsace)
- Musée Musée de L'Aventure Peugeot
- Musée Musée Minal
- Musée La Damassine
- Musée Le 19, Centre Regional d'Art Contemporain
- Musée Le 19
- Musée Château Montbéliard Wurtemberg
- Musée Le Pavillon des Sciences
- Musée Musée d'Art et d'Histoire Beurnier-Rossel
- Musée Micro-folie : musée numérique
- Musée Musée des Amis de Thann
- Musée Maison du patrimoine et des forges
- Musée L'Atelier du Pavillon des sciences
- Musée Centre d'Art d'Audincourt - Donation Patt
- Musée Espace Charles Kieffer
- Musée Musée Roger Comte
- Musée Musée de la Paysannerie et des Vieux Métiers
- Musée Musée de la Porte de Thann
- Musée Musée de Cernay
- Musée Musée de la Fête Foraine
- Musée Musée de la Mine et de la Potasse
- Musée Visite guidée : musée de la mine et de la potasse Joseph Else
- Musée Musée des Démineurs
- Musée Maison de la Négritude et des Droits de l'Homme
- Musée Cité du Train - Patrimoine SNCF
- Musée Musée Electropolis
- Musée Fondation François Schneider
- Musée Museum Dan Gerbo Contemporary Art
- Musée Musée Serret
- Musée La maison de l'ouvrier-paysan
- Musée Historial franco-allemand de la Grande Guerre au Hartmannswillerkopf
- Musée Le Parc de Wesserling - Ecomusée textile
- Musée La Kunsthalle - Centre d'art contemporain
- Musée La Kunsthalle Mulhouse
- Musée MicroFolie de la Vallée de Saint-Amarin
- Musée Musée du Sapeur Pompier
- Musée Musee de la Mine Marcel Maulini
- Musée La Galerie de la Filature
- Musée Musée National de l'Automobile - Collection Schlumpf
- Musée Maison du Patrimoine Edouard Boeglin
- Musée Musée Historique de Mulhouse
- Musée Musée de l'Impression sur Etoffes
- Musée Espace muséal Re-Naissance