- Musée Musée du Peigne et de la Plasturgie
- Musée Usine électrique la Grande Vapeur
- Musée Isarnodurum - Musée archéologique d'Izernore
- Musée Musée de la Résistance et de la Déportation de l'Ain
- Musée Musée rural "Vie et métiers d'autrefois"
- Musée Ecomusée Les Outils d'Autrefois
- Musée Moulin de Pont des Vents
- Musée Musée du Revermont
- Musée Musée de la Tournerie
- Musée Air St Lup
- Musée Vacances d'automne au musée du Jouet
- Musée Cuivrerie de Cerdon
- Musée Musée du jouet
- Musée Fort inférieur
- Musée Exposition Résistance et Déportation
- Musée Musée de l'Abbaye / donations Guy Bardone - René Genis
- Musée La fraternelle - Maison du Peuple
- Musée Musée de la Pipe et du Diamant
- Musée Le Monde des Automates
- Musée Atelier des savoir-faire
- Musée Écomusée Maison de Pays en Bresse
- Musée Calendrier gaulois et dieu de Coligny
- Musée Coligny Car Muséum
- Musée Espace Comté d'Aranc
- Musée Musée des Soieries Bonnet
- Musée Ecomusée les Vieux Clous
- Musée Maison du parc naturel régional du Haut-Jura