- Musée Musée de la batellerie
- Musée Chapelle des Jésuites
- Musée Musée des Beaux-Arts de Dole
- Musée Ma première visite au musée
- Musée Maison natale de Louis Pasteur
- Musée Maison du Patrimoine
- Musée Musée des sapeurs-pompiers (Pierre Morisot)
- Musée Maison du patrimoine rural jurassien
- Musée Musée des anciennes Forges
- Musée Le Parc du Château de Sainte-Marie
- Musée Parc de sculptures Île Art
- Musée Musée de plein air l'Etang Rouge
- Musée Baraques du XIV
- Musée Le Baccu
- Musée Musée de l'écluse 62
- Musée Musée de la Poterie Joseph Martin
- Musée Musée de plein air Étang Rouge
- Musée Halte Brunehaut
- Musée Musée de la Saône et des Gens de la Saône
- Musée La Bergerie
- Musée Salle du Patrimoine
- Musée Le Mirabellum
- Musée Galerie de quilles
- Musée Jura Météorites
- Musée Musée de l'Electricité Hippolyte Fontaine