- Musée Minéralogica
- Musée Musée de la Lauze
- Musée Musée de la Lauze
- Musée Musée-Maison du Patrimoine
- Musée Musée archéologique de Hières-sur-Amby
- Musée Patrimoine, culture et traditions
- Musée Musée de Saint-Chef
- Musée Musée de La Vie Rurale
- Musée Musée de Bourgoin-Jallieu
- Musée Musée-Galerie Clauorum
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- Musée Maison de la photographie Muroise
- Musée Maison de la Pierre et du Ciment
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- Musée La Grange Chevrotière
- Musée Apothicairerie de Montluel
- Musée Musée d'art et d'histoire locale
- Musée Musée du Vieux Pérouges
- Musée Musee Tour De Guet
- Musée Musée des Passions - Le Foulon
- Musée L’Aéromusée
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- Musée Musée Paléoécologique de Cerin
- Musée Musée de la vigne de Vaux-en-Bugey
- Musée Musée de l'Aviation Lyon-Corbas
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- Musée Conservatoire de la Fondation Berliet
- Musée Micro-Folie, musée numérique aux Avenières Veyrins-Thuellin
- Musée Musée de la Résistance et de la Déportation
- Musée Musée des Tisserands
- Musée Musée du Tisserand Dauphinois
- Musée Droguier de Lyon
- Musée Musée d'histoire de la médecine et de la pharmacie de Lyon
- Musée Classe-Musée
- Musée Musée Testut-Latarjet
- Musée Institut Lumière
- Musée Musée Lumière
- Musée Institut d'art contemporain
- Musée Musée du Cheminot
- Musée Cité musée Tony
- Musée Mémorial National de la prison de Montluc
- Musée Musée de l'informatique du centre de calcul de l'IN2P3
- Musée Musée des Moulages (MuMo)
- Musée Musée des traditions bugistes