- Musée La maison du Père Fouettard
- Musée Deumeure du Père Noël
- Musée Maison du Salève
- Musée Musée de la Vache et des Alpages
- Musée Musée Léon Marès
- Musée Musée du cinéma d'animation
- Musée Centre d’Interprétation de l’Architecture et du Patrimoine
- Musée Musée-Château d'Annecy
- Musée Musée d'art contemporain et d'art régional
- Musée Observatoire régional des lacs alpins
- Musée Maison de la Galerie
- Musée Musée de la Poterie Savoyarde
- Musée Musée français de la Fausse Monnaie
- Musée Ecomusée du Lac d'Annecy
- Musée Notre Histoire - Musée de Rumilly
- Musée Le pont des z'arts
- Musée Fort inférieur
- Musée Musée Paccard
- Musée Fondation Art Contemporain Claudine et Jean-Marc Salomon
- Musée Musée de la Cordonnerie
- Musée Maison de Pays du Laudon
- Musée Le Salève secret
- Musée Nécropole nationale des Glières / site de Morette
- Musée Musée départemental de la Résistance haut-savoyarde et mémorial départemental de la déportation
- Musée Mémoire du Maquis
- Musée Musée de la Nature
- Musée Ecomusée du Bois et de la Forêt
- Musée Musée Patrimonial du Pays de Thônes - Fondateurs : François et Lucien Cochat
- Musée Salle des maquettes des Amis du Val de Thônes
- Musée Maison des Mémoires
- Musée Musée du Bugey-Valromey
- Musée Musée du Batiment
- Musée Expomusee Faucigny
- Musée Moulin de Carra
- Musée Maison du Pays de Voltaire
- Musée Musée Gallo-Romain
- Musée Maison de l'Artisanat
- Musée Maison d'écrivain Michel Butor
- Musée Le Manoir des Livres