- Musée Cité des Climats et Vins de Bourgogne - Chablis
- Musée Vinéa Passion - Musée de la vigne et du vin
- Musée Musée de la Vigne et du Tire-Bouchon
- Musée Musée des Arts Naïfs et Populaires de Noyers
- Musée Hôpital
- Musée Musée du Chevalier d'Éon
- Musée Ecomusée de la Vigne et du Vin
- Musée La Maison des Pierreux
- Musée Musée Pierre Merlier
- Musée AJA Expérience
- Musée Maison d’écrivain de Marie Noël
- Musée Crypte et trésor de la Cathédrale Saint-Etienne d'Auxerre
- Musée Musée d'Art et d'Histoire
- Musée Micro Folie
- Musée Salle d'Eckmühl
- Musée Chapelle des Visitandines
- Musée Musée Leblanc-Duvernoy
- Musée Tour de Télégraphe Chappe
- Musée Musée de la Vigne et du Vieux Pressoir
- Musée Muséum d'Auxerre
- Musée Musée de la Faïencerie
- Musée Musée des outils anciens
- Musée Écomusée des Outils d'Autrefois
- Musée Musée
- Musée Musée en Florentinois
- Musée Moulin du Breuil
- Musée Le Musée Olaf DeLafon de l'automobile
- Musée Moulin à huile et à farine