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- Musée Musée du Rouet et du Grès d'Alsace
- Musée Musée d'Arces en Arts et Traditions
- Musée Un Rêve d'Enfant en 1/43
- Musée La Maison Du Vitrail d'Armance
- Musée Musée du Vitrail
- Musée Écomusée de la Valentaine
- Musée Moulin du Breuil
- Musée Musée de la Vigne et du Tire-Bouchon
- Musée Musée du Cidre du Pays d'Othe et magasin de la Ferme
- Musée Musée de la Pomme et du Cidre
- Musée Cité des Climats et Vins de Bourgogne - Chablis
- Musée Vinéa Passion - Musée de la vigne et du vin
- Musée Musée de la Résistance - Groupe Jovinien Bayard
- Musée Musée d'Art et d'Histoire
- Musée Chapelle des Visitandines
- Musée Crypte et trésor de la Cathédrale Saint-Etienne d'Auxerre
- Musée Micro Folie
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- Musée Maison d’écrivain de Marie Noël
- Musée Muséum d'Auxerre
- Musée Musée Leblanc-Duvernoy
- Musée Ecomusée de la Vigne et du Vin
- Musée AJA Expérience
- Musée Musée du Chevalier d'Éon
- Musée Hôpital
- Musée Musée des arts populaires
- Musée Musée Le Passé simple
- Musée Maison de la Préhistoire Othéenne
- Musée Musée du Moule à Chocolat