- Musée Musée du Peigne et de la Plasturgie
- Musée Usine électrique la Grande Vapeur
- Musée Ecomusée Les Outils d'Autrefois
- Musée Isarnodurum - Musée archéologique d'Izernore
- Musée Vacances d'automne au musée du Jouet
- Musée Musée de la Tournerie
- Musée Musée du jouet
- Musée Air St Lup
- Musée Moulin de Pont des Vents
- Musée Musée rural "Vie et métiers d'autrefois"
- Musée Atelier des savoir-faire
- Musée Exposition Résistance et Déportation
- Musée La fraternelle - Maison du Peuple
- Musée Musée de l'Abbaye / donations Guy Bardone - René Genis
- Musée Musée de la Résistance et de la Déportation de l'Ain
- Musée Musée de la Pipe et du Diamant
- Musée Le Monde des Automates
- Musée Musée du Revermont
- Musée Musée de la mode du 18ème 19ème siècle
- Musée Calendrier gaulois et dieu de Coligny
- Musée Coligny Car Muséum
- Musée Maison du parc naturel régional du Haut-Jura
- Musée Musée des Lapidaires
- Musée La Maison de la Flore
- Musée Musée des pierres et du lapidaire
- Musée Écomusée Maison de Pays en Bresse
- Musée La Maison de la Mémoire Cuisellienne
- Musée Musée de la Forge du Moulin
- Musée Fort inférieur
- Musée Cuivrerie de Cerdon