- Musée Écomusée de la Bresse bourguignonne
- Musée Musée municipal
- Musée Musée de plein air Étang Rouge
- Musée Musée de plein air l'Etang Rouge
- Musée Musée de la Saône et des Gens de la Saône
- Musée L'Etang de Jean
- Musée Musée du Blé et du Pain
- Musée La Maison de la Forêt et du Bocage
- Musée Maison de l'Agriculture et de l'Alimentation
- Musée Maison du patrimoine rural jurassien
- Musée Musée des sapeurs-pompiers (Pierre Morisot)
- Musée Maison du Patrimoine
- Musée Musée de la batellerie
- Musée Jura Météorites
- Musée P'tit musée de l'école communale
- Musée Musée du Vélo
- Musée Maison de la Poupée
- Musée Archéodrome de Beaune
- Musée Maison Plissonnier
- Musée Musée des salières
- Musée Cité des Climats et vins de Bourgogne - Beaune
- Musée Historial de l'Amitié Franco-Américaine de Beaune
- Musée Espace Patrimoine
- Musée Musée Nicéphore Niépce
- Musée Musée Bourdy
- Musée Musée Denon
- Musée Musée du Souvenir du Combattant