- Musée Château des Allymes
- Musée Musée du Cheminot
- Musée Musée de la vigne de Vaux-en-Bugey
- Musée Musée des traditions bugistes
- Musée Musée des Soieries Bonnet
- Musée Ecomusée les Vieux Clous
- Musée Espace Comté d'Aranc
- Musée Cuivrerie de Cerdon
- Musée Centre d'art contemporain de Lacoux
- Musée Musee Tour De Guet
- Musée Musée du Vieux Pérouges
- Musée Maison de la Pierre et du Ciment
- Musée Patrimoine, culture et traditions
- Musée Musée archéologique de Hières-sur-Amby
- Musée Musée-Maison du Patrimoine
- Musée Musée Louis Jourdan
- Musée Conservatoire de la Fondation Berliet
- Musée Musée de la Lauze
- Musée Musée municipal de Bourg-en-Bresse
- Musée Monastère Royal de Brou
- Musée Musée de la Résistance et de la Déportation de l'Ain
- Musée Musée de la Lauze
- Musée Apothicairerie de l'hôtel-Dieu
- Musée Musée de la Mécanographie
- Musée Musée Paléoécologique de Cerin
- Musée Missions 2070
- Musée Le Musée numérique
- Musée Musée du Bugey-Valromey
- Musée Musée d'art et d'histoire locale
- Musée Apothicairerie de Montluel
- Musée Isarnodurum - Musée archéologique d'Izernore