- Musée Cuivrerie de Cerdon
- Musée Musée des Soieries Bonnet
- Musée Ecomusée les Vieux Clous
- Musée Espace Comté d'Aranc
- Musée Château des Allymes
- Musée Centre d'art contemporain de Lacoux
- Musée Musée des traditions bugistes
- Musée Musée du Cheminot
- Musée Musée de la Résistance et de la Déportation de l'Ain
- Musée Musée de la vigne de Vaux-en-Bugey
- Musée Isarnodurum - Musée archéologique d'Izernore
- Musée Musée municipal de Bourg-en-Bresse
- Musée Monastère Royal de Brou
- Musée Apothicairerie de l'hôtel-Dieu
- Musée Musée de la Mécanographie
- Musée Le Musée numérique
- Musée Musée Louis Jourdan
- Musée Musée du Revermont
- Musée Musée du Bugey-Valromey
- Musée Musée du Peigne et de la Plasturgie
- Musée Écomusée Maison de Pays en Bresse
- Musée Musee Tour De Guet
- Musée Musée du Vieux Pérouges
- Musée Usine électrique la Grande Vapeur
- Musée Maison de la Pierre et du Ciment
- Musée Moulin de Pont des Vents